并设置interaction score>0.9

2.3 关键靶点的异病同治查找以及关键活性成分的查找
把38个共有靶点导入STRING数据库,并设置interaction score>0.9,基于机制构建PPI网络。网络PPI网络包含35个靶点以及121条边(图3A)。药理遥散抑郁利用Cytoscape 3.7.1软件的学探腺增性消MCODE插件对该网络进行聚类分析,共得到3个子网络。讨逍根据得分最高创建核心靶点网络图(图3B)。症乳作用核心靶标网络(得分8.222)中的生和节点有:IL-6、IL-4、异病同治TNF、基于机制IL-1A、网络ICAM1、药理遥散抑郁CCL2、学探腺增性消CXCL8、讨逍IL-1B、症乳作用IL-10和IFNG。
根据“单味药-活性成分-共同靶点”相互作用网络筛选得到的关键靶点搜寻到相应的8个关键活性成分:槲皮素(MOL000098)、山柰酚(MOL000422)、β-谷固醇(MOL000358)、芦荟大黄素(MOL000471)、Glyasperins M(MOL000354)、刺芒柄花素(MOL000392)、金合欢素(MOL001689)和柚皮素(M OL004328)。
2.4 通路分析
将上述获得的逍遥散治疗抑郁症、乳腺增生和功能性消化不良的共同靶点输入Metascape数据库进行KEGG通路注释分析。根据P<0.05对KEGG通路结果进行筛选,共得到17条相关通路,其中包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路 (AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)、HIF-1信号通路 (HIF-1 signaling pathway)以及癌症通路 (pathways in cancer)等通路(图4A)。GO富集结果表明,在生物过程(biological process)中,逍遥散对脂多糖(response to lipopolysaccharide)、活性氧代谢 (reactive oxygen species metabolic process)以及细胞因子介导的通路 (cytokine-mediated signaling pathway)等的影响较大;在分子功能(molecular function)层面上,逍遥散对细胞因子 (cytokine receptor binding)、磷酸酶 (phosphatase binding)以及血红素(heme binding)等的影响较大;在细胞组分(cellular component)中,逍遥散对膜筏 (membrane raft)、囊泡(vesicle lumen)以及核包膜 (nuclear envelope)的影响较大(图4B)。
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